药师佛曾经发下十二大愿，立志要帮助末法时期的受苦众生。

　　药师佛之十二大愿是：

　　（1）愿我来世得菩提时，自身光明炽然，照耀无量世界，以三十二相、八十种好庄严，令一切众生如我无异。

　　（2）愿身如琉璃，内外清净无瑕垢，光明过日月，令于昏暗中之人能知方所，随意所趣，作诸事业。

　　（3）以智慧方便众生，令众生受用无尽。

　　（4）令行异道者，安立于菩萨道中，行二乘道者，以大乘安立之。

　　（5）令于我法中修行梵行者，一切皆得不缺减戒。

　　（6）令诸根不具之聋盲跛躄白癞颠狂，乃至种种身病者，闻我名号皆得诸根具足、身分成满。

　　（7）令诸患逼切无护无依，远离一切资生医药者，闻我名号，众患悉除。

　　（8）若女人愿舍女形者，闻我名号，得转丈夫相，乃至究竟无上菩提。

　　（9）令一切众生解脱魔网，安立于正见。

　　（10）令为王法系缚，无量灾难煎迫者，皆得解脱一切苦恼。

　　（11）令饥火烧身，为求食故作诸恶业者，先得妙色香味饱身，后以法味毕竟安乐。

　　（12）贫无衣服者，我当施以所用衣服，乃至庄严具。